El ICSOH es el resultado de la fusión del Centro Promocional de Investigaciones en Historia y Antropología "Dr. Guillermo Madrazo" (CEPIHA) y del Instituto de Investigaciones Sociocríticas y Comparadas (INSOC), ambos institutos de la Facultad de Humanidades de la UNSa creados en los años 80 y 90.
El CEPIHA se convirtió en un polo de desarrollo de la arqueología y etnohistoria regional desde la asunción como su director del arqueólogo pampeano Dr. Madrazo (1927-2004) en 1989.
Logro destacado: Madrazo creó la prestigiosa Revista Andes, Historia y Antropología que se publica hasta la actualidad.
El INSOC fue creado en 1999 como dependencia de la Facultad de Humanidades de la UNSA, con el objetivo de promover investigaciones en el campo de las disciplinas sociales y humanas en el ámbito del Noroeste Argentino.
Entre 2014 y 2024 fueron directoras del ICSOH:
Desde 2024, dirige el instituto el Dr. Guillermo Wilde.
La trayectoria acumulada de más de 30 años brinda al ICSOH una proyección nacional, regional e internacional sólida, cimentada en el desarrollo continuo de actividades, productividad científica y una infraestructura sólida y en crecimiento.